FPの回答へコメント

すでにご回答されている方とほぼ同じですが、今後の奥さまの働き方、借入の方法、借入金額により変わってくると思われます。
取得控除をダブルで受けれるメリットはありますが、今後出産を機に退職されたり、パートなどで収入減少の可能性がある場合は持分を少なくしておいた方がいいかもしれません。
将来離婚なんてことがあれば、少しでも自分の持ち分を多くと、減価償却されない土地のみ持ち分をつけた方もいますし、私は共働きでしたが、借り入れは主人だけの債務だったので、持分はつけませんでした。
返ってくる税金だけでなく、支払う方の税金も変わるものがあるので、一言では結論が出せません。